Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnpy3Q9DAU1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnpy3Q9DAU1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnpy3Q9DAU1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnpy3Q9DAU1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms