Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D7E4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms