Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpap3Q9D706 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap3Q9D706 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms