Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2cQ9D1C1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2cQ9D1C1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2cQ9D1C1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2cQ9D1C1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2cQ9D1C1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2cQ9D1C1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms