Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.4 ms