Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssr1Q9CY50 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms