Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atxn3Q9CVD2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn3Q9CVD2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn3Q9CVD2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms