Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vta1Q9CR26 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vta1Q9CR26 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms