Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PompQ9CQT5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms