Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc5Q9CQA1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc5Q9CQA1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms