Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SptssbQ925E8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms