Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb6Q922F4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubb6Q922F4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms