Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vangl2Q91ZD4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Vangl2Q91ZD4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms