Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL3Q8ND23 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL3Q8ND23 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms