Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam20aQ8CID3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam20aQ8CID3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms