Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcerg1Q8CGF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tcerg1Q8CGF7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tcerg1Q8CGF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms