Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc73Q8CDM4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc73Q8CDM4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms