Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CCC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CCC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CCC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CCC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CCC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CCC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CCC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms