Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn5Q8CBA2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn5Q8CBA2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms