Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo48Q8CAT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo48Q8CAT8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo48Q8CAT8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo48Q8CAT8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo48Q8CAT8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo48Q8CAT8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 303.8 ms