Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam53cQ8BXQ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam53cQ8BXQ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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