Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp38Q8BW70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms