Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130116L18RikQ8BMV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130116L18RikQ8BMV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130116L18RikQ8BMV6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms