Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcal1Q8BJL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcal1Q8BJL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcal1Q8BJL0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms