Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmco3Q8BH01 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco3Q8BH01 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms