Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubash3bQ8BGG7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms