Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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