Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sptlc3Q8BG54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptlc3Q8BG54 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptlc3Q8BG54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms