Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Jmjd4Q8BFT6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Jmjd4Q8BFT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Jmjd4Q8BFT6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Jmjd4Q8BFT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms