Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4cQ811C2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4cQ811C2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms