Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efr3bQ6ZQ18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efr3bQ6ZQ18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efr3bQ6ZQ18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms