Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2eQ6VUP9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2eQ6VUP9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms