Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd300lfQ6SJQ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd300lfQ6SJQ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms