Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4aQ6Q473 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca4aQ6Q473 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms