Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtifQ6PEE2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtifQ6PEE2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms