Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bend3Q6PAL0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bend3Q6PAL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bend3Q6PAL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms