Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc189Q6NZQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc189Q6NZQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc189Q6NZQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms