Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms