Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt40Q6IFX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt40Q6IFX3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt40Q6IFX3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt40Q6IFX3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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