Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Best3Q6H1V1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Best3Q6H1V1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms