Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr2Q62371 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr2Q62371 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr2Q62371 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms