Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlcamQ61490 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms