Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf9Q61179 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms