Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DbpQ60925 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DbpQ60925 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DbpQ60925 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms