Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a3Q5XF89 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a3Q5XF89 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a3Q5XF89 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms