Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhfpl4Q5U4E0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl4Q5U4E0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms