Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo1dQ5SYD0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myo1dQ5SYD0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo1dQ5SYD0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms