Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brip1Q5SXJ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Brip1Q5SXJ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brip1Q5SXJ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms