Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r196Q5SVD5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms