Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TefmQ5SSK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms